(一)第一辦公室(金門縣金城鎮民權路178號4樓)
四樓:檢察長辦公室、書記官長室、主計室、人事室、總務科、資訊室、收發室
(二)第二辦公室(金門縣金城鎮民權路174號)
一樓:偵查庭、駕駛休息室、警衛室、檔案室、福建更生保護會、法律扶助金門分會
二樓:檢察官辦公室、書記處、紀錄科、執行科、研考科、文書科、圖書室 、會議室